تصویری: آیا می توانید محصول PCR را توالی یابی کنید؟
2024 نویسنده: Stanley Ellington | [email protected]. آخرین اصلاح شده: 2023-12-16 00:16
مستقیم ترتیب دهی از محصولات PCR . به طور مستقیم امکان پذیر است توالی آ محصول PCR بدون کلون کردن قطعه. مستقیم تعیین توالی PCR به ندرت موفق است مگر اینکه شما مدتی را برای اطمینان از آن صرف کنید شما نمی افتند یکی از تله های فراوان
به این ترتیب تعیین توالی PCR چیست؟
مستقیم ترتیب دهی از PCR محصولات. شما باید همه را حذف کنید PCR آغازگرها و نوکلئوتیدهای ترکیب نشده قبل از محصول است توالی شده . ترتیب دهی فقط از یک پرایمر به جای دو پرایمر استفاده می شود PCR . اگر هر دو پرایمر را حذف نکنید، دو پرایمر دریافت خواهید کرد دنباله ها روی یکدیگر قرار گرفته اند که قابل خواندن نیستند.
به همین ترتیب، آیا می توانم از پرایمرهای PCR برای تعیین توالی استفاده کنم؟ پرایمرهای PCR در نظر گرفته شده اند PCR تقویت برای به دست آوردن یک آمپلیکون آغازگرهای توالی یابی هستند استفاده شده به توالی یک قطعه DNA و نشان دادن DNA آن توالی شناسایی 4. دو پرایمرهای PCR در الف مورد نیاز هستند PCR واکنش (معمولا)؛ فقط یکی پرایمر توالی یابی به الف اضافه می شود ترتیب دهی واکنش.
با در نظر گرفتن این موضوع، چگونه محصولات PCR را آزمایش می کنید؟
تشخیص و تجزیه و تحلیل محصولات PCR . این تولید - محصول از یک PCR باید قطعه یا قطعاتی از DNA با طول مشخص باشد. بسیاری از تکنیک ها را می توان برای تشخیص توالی های تقویت شده استفاده کرد (جدول را ببینید). ساده ترین و رایج ترین روش الکتروفورز است محصول PCR روی ژل آگارز با EtBr (اتیدیوم بروماید).
چرا لازم است محصولات PCR قبل از تعیین توالی خالص شوند؟
تطهیر DNA از a PCR واکنش به طور معمول است لازم برای استفاده در پایین دست، و حذف آنزیم ها، نوکلئوتیدها، آغازگرها و اجزای بافر را تسهیل می کند.
توصیه شده:
توالی یابی DNA سنگر چگونه کار می کند؟
توالی Sanger منجر به تشکیل محصولات فرمت با طول های مختلف می شود که در انتهای 3 'با دیودوکسینوکلئوتیدها خاتمه می یابد. سپس محصولات اکستنشن توسط الکتروفورز مویرگی یا CE جدا می شوند. مولکول ها توسط جریان الکتریکی به مویرگ شیشه ای بلند پر شده از ژل پلیمر تزریق می شوند
چگونه هزینه واحد محصول را با استفاده از هزینه یابی سنتی پیدا می کنید؟
مجموع هزینههای مستقیم مواد، کل هزینههای مستقیم نیروی کار و کل هزینههای سربار تولیدی که در طول دوره متحمل شدهاید را با هم جمع کنید تا کل هزینههای محصول خود را تعیین کنید. برای تعیین هزینه محصول به ازای هر واحد، نتیجه خود را بر تعداد محصولاتی که در طول دوره تولید کردید تقسیم کنید
وظیفه DdNTP در توالی یابی DNA چیست؟
DdNTP شامل ddATP، ddTTP، ddCTP و ddGTP است. DdNTP در تجزیه و تحلیل ساختار DNA مفید است زیرا پلیمریزاسیون یک رشته DNA را در طول همانندسازی DNA متوقف می کند و طول های مختلف رشته های DNA را از یک رشته الگو تولید می کند
چگونه PCR در تعیین توالی DNA دی اکسی نقش دارد؟
چگونه PCR در تعیین توالی DNA دی اکسی نقش دارد؟ استفاده از PCR به سطوح قابل تشخیص سنتز DNA از سطوح بسیار پایین تر DNA الگو اجازه می دهد. چرا ادغام یک دی اکسی نوکلئوتید در طول توالی یابی DNA به عنوان یک رویداد "پایان دهنده تکرار" شناخته می شود؟
تفاوت بین توالی سنگر و توالی یابی نسل بعدی چیست؟
فن آوری های توالی یابی نسل بعدی (NGS) مشابه هستند. تفاوت اساسی بین Sangersequencing و NGS حجم توالی است. در حالی که روش سانجر تنها یک قطعه DNA را در هر زمان توالی یابی می کند، NGS بسیار موازی است و میلیون ها قطعه را به طور همزمان در هر اجرا توالی می کند